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摘要:
利用玉米B73全基因组53 764个基因的表达序列数据,使用多重变量分析软件CodonW对影响密码子用法的因素进行分析.结果表明:在59种同义密码子中有27种为玉米最优密码子.同时还指出,最优密码子的使用频率(FOP)与基因的G+C含量(GC),尤其是第3位密码子的G+C百分含量(GC3S)、密码子适应指数(CAI)和密码子偏爱指数(CBI)之间均呈现极显著的正相关(相关系数分别为r=0.780 7、0.822 3、0.731 4和0.986 3),而与有效等位基因数ENc存在显著负相关(相关系数r=-0.681 5).表明基因GC含量直接影响玉米密码子使用的偏性,同时基因的表达水平越高,对密码子的使用偏向性越强.27个最优密码子的首次确定将对玉米转基因具有重要指导意义.
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文献信息
篇名 玉米同义密码子使用偏性分析
来源期刊 黑龙江农业科学 学科 农学
关键词 玉米 同义密码子使用偏性 最优密码子 GC含量
年,卷(期) 2010,(7) 所属期刊栏目 生物技术
研究方向 页码范围 1-4
页数 分类号 S513.035.3|Q755
字数 3505字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1002-2767.2010.07.001
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 于金海 黑龙江省农业科学院作物育种研究所 7 23 3.0 4.0
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玉米
同义密码子使用偏性
最优密码子
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黑龙江农业科学
月刊
1002-2767
23-1204/S
大16开
哈尔滨市南岗区学府路368号
14-61
1978
chi
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