菠萝杆状DNA病毒的全基因组序列测定及分析

• 作者: 吴丽婷 李华平 沈文锦 翟国会 谭小勇 阮小蕾
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 菠萝 菠萝杆状DNA病毒 杆状DNA病毒属 全序列
• 年，卷（期）: 2010,（9）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1969-1976
• 分类号: S6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.09.026

摘要

[目的]证明中国湛江地区菠萝上是否存在菠萝杆状DNA病毒(Pineapple bacilliform comosus virus,PBCoV),并获得PBCoV的基因组全序列,分析该病毒与其它Badnavirus病毒分离物间的分子差异.[方法]设计特异引物,通过反向PCR及分段克隆两种方法扩增PBCoV,克隆后测序获得PBCoV基因组全序列,利用不同生物学软件进行序列分析.[结果]PBCoV基因组为环状结构,全长7543 bp;含有3个典型的ORFs,推测其编码蛋白的分子量分别为20.4、14.0和217.6 kD.其基因组与GenBank登录的PBCoV ORF3部分核苷酸序列同源性87%-97%,其ORF3编码的氨基酸序列与已报道的Badnavirus病毒ORF3氨基酸序列问一致率小于50.8%.Southern blot分析显示该病毒基因组能整合到植物基因组中.[结论]在中国湛江地区菠萝上存在PBCoV,该病毒属于Badnavirus属病毒,与香蕉线条病毒(Banana streak virus)Mys分离物(BSV-Mys)亲缘关系最近.这是PBCoV基因组全序列的首次报道.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李华平	华南农业大学植物病毒研究室	99	1081	19.0	27.0
2	阮小蕾	华南农业大学植物病毒研究室	32	216	8.0	13.0
3	沈文锦	华南农业大学植物病毒研究室	3	11	2.0	3.0
4	翟国会	华南农业大学植物病毒研究室	3	24	3.0	3.0
5	吴丽婷	华南农业大学植物病毒研究室	4	24	3.0	4.0
6	谭小勇	华南农业大学植物病毒研究室	3	24	3.0	3.0