使用组合分类器预测蛋白质相互作用

• 作者: 周正荣 宋晓峰 王明浩
• 来源期刊: 电子学报
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质相互作用 编码 支持向量机 组合分类器投票
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 所属期刊栏目: 科研通信
• 页码范围: 1464-1467
• 分类号: TP274
• 字数: 4149字
• 语种: 中文

摘要

蛋白质必须通过与其他蛋白质之间的相互作用才能行使其功能,因此,对于蛋白质相互作用的研究显得尤为重要.针对蛋白质相互作用预测问题,本文提出了一种基于不同特征编码的组合分类器投票的预测方法.该方法综合考虑了蛋白质序列中氨基酸频率、氨基酸位置、氨基酸理化性质和氨基酸生物相似性等特征.在真实的蛋白质相瓦作用human数据集上,使用支持向量机根据不同特征编码建立的预测模型,分别作为组合分类器中的子分类器进行投票.结果表明,该方法能有效提高蛋白质相互作用预测的性能,且预测结果与其他方法相比也具有一定优势.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋晓峰	南京航空航天大学自动化学院生物医学工程系	45	295	8.0	16.0
2	周正荣	南京航空航天大学自动化学院生物医学工程系	1	6	1.0	1.0
3	王明浩	南京航空航天大学自动化学院生物医学工程系	1	6	1.0	1.0