胰腺癌蛋白表达谱的生物信息学分析

• 作者: 周小艳 崔亚洲 李天亮 钟宁 韩金祥
• 来源期刊: 中华肿瘤防治杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 胰腺肿瘤 蛋白质组学 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 423-426
• 页数: 4页
• 分类号: R735.9
• 语种: 中文

摘要

目的:通过生物信息学方法分析胰腺癌蛋白质组学数据.方法:对通过蛋白质组学方法筛选出的98种胰腺癌表达上调蛋白使用NCI-Nature、Ospreyl.2.0和DAVID软件分别进行信号通路分析、蛋白质相互作用分析及基因本体论(Gene Ontology,GO)分析.结果:98种基因共涉及50条信号通路,其中富集度P值＜0.05的信号通路有15条,最具显著性的为HIF-α转录因子信号通路;98种基因在"细胞骨架生成"、"细胞骨架"及"蛋白结合"3种GO中富集度最为显著;在蛋白相互作用网络中,连接度最高的为Ezrin和Vimentin.结论:利用生物信息学方法对蛋白质组学数据进行挖掘,可以为进一步了解胰腺癌的发病机制提供新的思路.