人miR-34a靶基因的生物信息学分析及载体构建

• 作者: 傅博 刘晓峦 吕杨 崔敬 杨聚荣 洪权 蔡广研 谢院生 陈香关
• 来源期刊: 军医进修学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: hsa-miR-34a 自噬 基因,报告
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 467-469
• 分类号: R339.38
• 字数: 1815字
• 语种: 中文

摘要

目的 对人miR-34a(hasa-miR-34a)下游靶基因进行预测,并构建含自噬相关基因靶结合序列的GFP报告基因载体.方法 使用TargetScan Release 5.1和RNA22软件分析hsa-miR-34a可能的靶基因,并利用Gominer软件对靶基因功能进行分析.根据预测结果 ,合成含自噬相关基因hsa-miR-34a靶序列的寡核苷酸,以pEGFPC2为载体构建系列质粒,并检测各载体的真核表达情况.结果 预测结果 显示hsa-miR-34a共有2 904个下游靶基因,功能涵盖生物过程、细胞组分、分子功能三大类,其中与自噬作用直接相关的靶基因有beclin 1和sestrin 2.构建含beclin 1和sestrin 2作用位点的GFP载体共5个,质粒转染Hela细胞后在荧光显微镜下可见绿色荧光.结论 成功构建hsa-miR-34a下游自噬相关基因靶位点序列GFP报告基因载体,为进一步研究hsa-miR-34a对自噬的调控作用奠定基础.