水稻多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因(Ospgipl)原核表达及编码产物生物信息学分析

• 作者: 刘晓维 左示敏 徐敬友 潘学彪 童蕴慧 陈夕军
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 农学
• 关键词: 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 原核表达 生物信息学分析 纹枯病 水稻
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 136-142
• 分类号: Q943.2|S435.111.4+2|S511.03
• 字数: 5113字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7216.2011.02.003

摘要

据GenBank及相关文献提供的序列,从水稻基因组DNA中扩增出930 bp的Ospgipl基因完整开放阅读框.原核表达Ospgipl基因,表达产物能显著抑制水稻纹枯病菌菌丝生长及其多聚半乳糖醛酸酶活性.生物信息学分析表明,OsPGIPl为分子量32.8 kDa、pI 7.26的疏水蛋白,主要位于细胞壁(55.6%),信号肽切点位于第17和18位氨基酸之间.在N端和C端各有4个半胱氨酸残基,形成3个二硫键(第56和63位、第278和298位、第300和308位氨基酸).以α-螺旋、β-折叠和不规则盘绕等为主要结构原件,具有典型的富含亮氨酸重复(LRR)结构.相比其他植物的PGIP,OsPGIPI缺少第7个LRR.在空间上9个LRR形成类似凹陷或裂隙结构,可能是其与病原菌多聚半乳糖醛酸酶互作的活性位点区.