基于BRB-ArrayTools和GATHER工具对膀胱癌相关基因的挖掘及生物信息学分析

• 作者: 万沛 李飞 梁中锟 石小军 荆玉明 谭万龙 陈三三
• 来源期刊: 临床泌尿外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学 膀胱癌 基因表达谱 BRB Array Tools软件
• 年，卷（期）: 2011,（11）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 852-855
• 分类号: R737.14
• 字数: 3368字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-1420.2011.11.020

摘要

目的:从分子水平探讨膀胱癌的发病机制,为临床诊疗提供新思路.方法:从公共基因芯片数据库(GEO)中下载人膀胱癌的相关基因芯片数据,使用BRB-ArrayTools软件对其进行分析,筛选差异基因；并利用GATHER工具进行生物信息学分析.结果:BRB分析发现122个差异表达基因,其中上调55个,下调67个；GATHER分析发现这些差异基因的功能主要集中在细胞的生理过程、细菌凝聚反应的诱导作用、Jak-STAT和Toll-like受体的信号通路及细胞因子相互作用等生物学过程.结论:利用生物信息学方法能有效分析基因芯片数据并获取内在信息,为确定膀胱癌的早期诊断标志与治疗靶点提供新的思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁中锟	南方医科大学南方医院泌尿外科	10	17	3.0	3.0
2	谭万龙	南方医科大学南方医院泌尿外科	96	554	13.0	20.0
3	李飞	南方医科大学南方医院泌尿外科	41	260	9.0	14.0
4	荆玉明	南方医科大学南方医院泌尿外科	1	3	1.0	1.0
5	石小军	南方医科大学南方医院泌尿外科	3	9	2.0	3.0
6	陈三三	南方医科大学南方医院泌尿外科	1	3	1.0	1.0
7	万沛	南方医科大学南方医院泌尿外科	1	3	1.0	1.0