RhoGDI2基因抑制膀胱癌转移涉及基因和信号通路的生物信息学分析

• 作者: 刘翰楠 唐勇 李秀宁 王琪 高超
• 来源期刊: 中国癌症防治杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 膀胱肿瘤 RhoGTP酶GDP解离抑制因子2 基因 信号通路 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 18-22
• 页数: 5页
• 分类号: R737.14
• 字数: 4021字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-5671.2015.01.04

摘要

目的 利用生物信息学方法探讨RhoGTP酶GDP解离抑制因子2(rho GDP dissociation inhibitor 2,RhoGDI2)基因抑制膀胱癌转移涉及的基因和信号通路.方法 从GEO datasets数据库搜索膀胱癌转移相关的全基因组表达谱芯片数据,使用GEO2R在线工具分析膀胱癌组织中RhoGDI2基因高表达组与低表达组之间的差异表达基因,再筛选出多组表达谱芯片数据中一致性上调或下调的基因,最后使用DAVID在线工具进行差异表达基因信号通路富集.结果 得到RhoGDI2基因在膀胱癌组织中高表达组和低表达组一致性高的差异表达基因,其中A 2M、COROIA、ENC1、FGD3为上调基因中一致性高的差异表达基因.通过基因信号通路富集分析得到膀胱癌组织中RhoGDI2基因调控的主要信号通路为Vav-RhoA-ROCK-MLC和Ras-Raf-MEK.结论 RhoGDI2基因可能通过Vav-RhoA-ROCK-MLC和Ras-Raf-MEK信号通路调节肌丝蛋白、细胞骨架以及细胞的增殖、分化等,进而抑制膀胱癌转移.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐勇	南宁广西医科大学附属肿瘤医院泌尿外科	3	5	2.0	2.0
2	李秀宁	南宁广西医科大学研究生学院	1	3	1.0	1.0
3	高超	南宁广西医科大学附属肿瘤医院泌尿外科	1	3	1.0	1.0
4	刘翰楠	南宁广西医科大学附属肿瘤医院泌尿外科	1	3	1.0	1.0
5	王琪	530021 南宁 广西肿瘤防治研究所实验研究部	2	3	1.0	1.0