基于复杂网络的随机森林算法预测氨基酸突变对蛋白质稳定性的影响

• 作者: 文志宁 方正 李功兵 李梦龙 李益洲 肖嘉敏
• 来源期刊: 化学研究与应用
• 学科: 化学
• 关键词: 氨基酸突变 蛋白质稳定性 随机森林 复杂网络
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 554-558
• 分类号: O657
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1656.2011.05.008

摘要

利用机器学习方法对单个氨基酸突变引起的蛋白质稳定性变化进行精确地预测,对蛋白质的结构和功能方面的研究具有重要的价值,并且对设计新的蛋白质及蛋白质工程学具有一定的指导意义.通过对蛋白质网络拓扑特征的研究,发现网络拓扑特征对于蛋白质突变稳定性影响具有较高的准确率.基于蛋白质网络拓扑特征的随机森林算法,能较好的对蛋白质单点突变所造成的稳定性改变进行预测,总准确率达到86%,MCC值达到0.67,并优于文献报道的预测结果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李梦龙	四川大学化学学院	79	604	14.0	20.0
2	文志宁	四川大学化学学院	18	111	6.0	10.0
3	方正	四川大学化学学院	20	433	9.0	20.0
4	李功兵	四川大学化学学院	2	12	2.0	2.0
5	李益洲	四川大学化学学院	10	18	3.0	4.0
6	肖嘉敏	四川大学化学学院	2	8	1.0	2.0