高效检测板栗群体基因频率方法的建立

• 作者: 刘庆忠 孙山 张力思 李国田 艾呈祥 苑克俊
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 板栗群体 SSR 多重PCR 混和样本 基因频率
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 176-181
• 页数: 6页
• 分类号: S664.2
• 语种: 中文

摘要

以17个板栗群体为试材,采用ABI全自动遗传分析仪,利用5'端荧光标记的SSR引物,通过混合样本中PCR产物检测峰高与丰度对应,分析基因频率,建立板栗群体混合样本等位基因及其频率的分析方法.与聚丙烯酰胺凝胶电泳银染法相比,ABI全自动遗传分析仪的检测灵敏度高,荧光引物CmTCR10(NED)共检测到78个等位基因,平均每个群体4.6个;引物CmTCR24(6-FAM)检测到41个等位基因,平均每个群体2.4个.多重PCR荧光SSR检测结果显示,可以明确区分不同的等位基因.荧光SSR能准确地读出片段大小,定量PCR扩增产物的丰度.用GeneScan获取数据,用Genotyper软件对数据进行设置与输出,使用R软件的FREQS-R模块,初步探讨利用荧光SSR定量化数据,计算供试群体混合样本的等位基因频率,可通过荧光SSR产物的丰度来确定混合取样群体的基因频率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘庆忠		192	2971	28.0	45.0
2	孙山		93	592	14.0	22.0
3	苑克俊		60	475	10.0	19.0
4	艾呈祥		58	591	14.0	22.0
5	李国田		32	183	9.0	12.0
6	张力思		60	665	17.0	23.0