舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签的生物信息学分析

• 作者: 孙守娟 季平 漆小娟 邹波
• 来源期刊: 重庆医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肿瘤干细胞 舌鳞癌 表达序列标签 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2011,（10）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 1233-1236
• 分类号: R739.8
• 字数: 3602字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-3626.2011.10.023

摘要

目的:对利用抑制消减杂交技术获得的舌鳞癌干细胞相关表达序列标签(Expressed squence tag,EST)进行电子克隆及序列分析.方法:利用互联网上的公共数据库及生物信息学分析软件对获得的舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签进行核酸序列和蛋白质序列分析,探索克隆差异表达基因的研究方法和策略.结果:通过电子延伸得到1个1 705 bp的cDNA序列；核酸序列分析显示,该cDNA定位在1号染色体,含有1个编码146个氨基酸的完整开放阅读框；对氨基酸序列进行结构域预测显示其存在1个与Translin超家族同源的区域；BLAST比对显示该氨基酸序列与Translin相关蛋白X(Translin associated protein X,TRAX)具有较高的同源性.结论:利用生物信息学技术获得了舌鳞癌相关表达序列标签的基本信息,为深入研究该表达序列标签的功能奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	季平	重庆医科大学附属口腔医院颌面外科	71	168	5.0	8.0
2	孙守娟	重庆医科大学附属口腔医院颌面外科	9	13	3.0	3.0
3	邹波	重庆医科大学附属口腔医院颌面外科	10	13	3.0	3.0
4	漆小娟	重庆医科大学附属口腔医院颌面外科	6	7	2.0	2.0