氨磷汀调控人类造血及免疫相关基因的筛选及生物信息学预测

• 作者: 井绪臣 刘丽宏 卢学春 杨波 脱帅 脱朝伟 迟小华
• 来源期刊: 军医进修学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 氨磷汀 基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 752-754
• 页数: 3页
• 分类号: R34
• 字数: 2455字
• 语种: 中文
• DOI: CNKI:11-3275/R.20110127.0928.000

摘要

目的 利用开放性基因芯片数据库筛选氨磷汀调控人类造血及免疫相关基因并对其进行生物信息学分析.方法 以氨磷汀(Amifostine)为关键词,在互联网开放性数据库包括GEO、SAGE、GeneCard、InterPro、ProtoNet、UniProt和BLOCKS中搜索基因表达数据,对筛选出的数据库进行生物信息学分析,计算差异表达基因,再利用The Database for Annotation,Visualization andIntegrated Discovery(DAVID)数据库进行造血及免疫相关基因的功能聚类分析.结果 仅在GEO数据库中筛选出1个氨磷汀调控人类基因组表达数据库.分析表明,氨磷汀处理K562细胞后,人类全基因组仅2.14%(460/192 000)的基因在转录水平表达有显著差异(P＜0.01).460个差异基因中有139条为已知功能基因,聚类分析共筛出17个与造血及免疫相关的基因,分属于8大类生物学通路,其中上调基因15个,下调基因2个.结论 充分利用开放性基因芯片数据库,可经济、方便和快捷地分析药物调控人类基因表达谱特点,为预测和验证药物新的药理作用提供指导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘丽宏	解放军第二炮兵总医院药剂科	16	97	5.0	9.0
2	脱朝伟	解放军第202医院电镜室	17	45	4.0	5.0
3	卢学春	解放军总医院南楼血液科	90	756	15.0	21.0
4	脱帅	解放军第202医院电镜室	8	24	3.0	4.0
5	杨波	解放军总医院南楼血液科	117	631	13.0	18.0
6	迟小华	解放军第二炮兵总医院药剂科	20	183	7.0	13.0
7	井绪臣	佳木斯市中心医院药剂科	6	14	2.0	3.0