基于Gibbs采样与遗传算法的模体识别

• 作者: 刘文远 王宝文 王常武 田陆芳
• 来源期刊: 计算机工程
• 学科: 工学
• 关键词: 模体识别 遗传算法 Gibbs采样 IUPAC简并码
• 年，卷（期）: 2011,（14）
• 所属期刊栏目: 人工智能及识别技术
• 页码范围: 180-182
• 分类号: TP393.06
• 字数: 2734字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3428.2011.14.060

摘要

借鉴Gibbs采样思想,将序列峰值所对应的候选模体作为遗传算法的初始种群,提出一种改进的模体识别算法.将模体在序列中的出现次数作为变量加入到适应度函数中,使其更符合生物数据的特性.在算法变异操作中加入IUPAC简并码保持种群的多样性.对DBTSS数据库中的真实数据进行测试,结果表明该算法具有较高的识别精度和较快的搜索速度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王常武	燕山大学信息科学与工程学院	32	175	6.0	12.0
2	刘文远	燕山大学信息科学与工程学院	154	739	14.0	19.0
3	王宝文	燕山大学信息科学与工程学院	54	237	8.0	12.0
4	田陆芳	燕山大学信息科学与工程学院	1	0	0.0	0.0