黄瓜全基因组转录因子MADS—box家族基因的序列特征分析

• 作者: 丁飞 庄丹 梁丹迪 甘德芳
• 来源期刊: 核农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 MADS—box 转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1249-1256
• 分类号: S511.01
• 语种: 中文

摘要

MADS-box家族基因是一类编码转录因子的基因，因其在调控植物生长发育方面的重要功能而成为作物遗传育种研究的热点。采用生物信息学方法，对黄瓜全基因组MADS-box基因进行序歹t1特征分析，包括CsMADS基因的数量、染色体定位、保守基序的分布及系统进化树分析。结果表明，黄瓜基因组中共有41个CsMADSs基因，除7个分布于Scaffold外，其他34个CsMADSs基因分布于黄瓜7条染色体上，但在染色体上的分布不是均匀的；41个CsMADSs都具有保守的MADS结构域，分布于9个MADS亚家族，而且大部分的CsMADSs基因属于SEP和MEF2．1ike分支。该研究结果不仅有助于MADS-box转录因子信号转导途径的解析，而且可为进一步研究该家族基因的功能提供信息参考。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	甘德芳	安徽农业大学园艺学院	23	103	6.0	9.0
2	丁飞	安徽农业大学园艺学院	3	35	2.0	3.0
3	庄丹	安徽农业大学园艺学院	3	19	2.0	3.0
4	梁丹迪	安徽农业大学园艺学院	1	12	1.0	1.0