苹果SUPERMAN类蛋白家族的基因克隆与生物信息学分析

• 作者: 任雪芹 张文 朱元娣 李皓 赵旭勉
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 苹果 SUPERMAN类基因 转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 782-790
• 页数: 9页
• 字数: 5774字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2012.07.008

摘要

SUPERMAN类基因是植物生长发育中的重要转录因子.为了揭示苹果SUPERMAN类蛋白家族的生理基因功能,本研究以富士苹果(Malus domestica Borkh.cv.Fuji)为试材,利用RT-PCR方法和锚定PCR方法克隆了MdLIFa(GenBank登录号HM370493)和启动子序列,利用特异引物PCR方法克隆了苹果基因组中其余11个SUPERMAN类基因.12个基因命名为MdLIFa/MdLIFb(GenBank登录号:HQ260429)、MdSUP1a(HQ418477)/MdSUP1b(HQ418478)、MdSUP4(HQ418475)/MdSUP12(HQ418476)、MdSUP5a(HQ418469)/MdSUP13b(HQ418470)、MdSUP9a(HQ418473)/MdSUP9b(HQ418474)和MdSUP5b(HQ418471)/MdSUP13a(HQ418472),分别位于11/3、1/1、4/12、5/13、9/未知和5/13号染色体,每对基因间的同源性均在86％以上.通过基因枪法轰击洋葱(Allium cepa)表皮细胞,基因瞬时表达证明MdLIFa定位于细胞核内.MdLIFa基因启动子序列中含有多个参与花粉发育、根特异性表达、与光诱导和Dof单锌指基因家族作用的调控元件等.系统进化分析表明,MdLIFa/b、MdSUP9a/9b和MdSUP5a/13b、以及MdSUP1a/b、MdSUP5b/MdSUP13a和MdSUP4/12分别聚类为一组,参与植株的形态建成和花器官发育.苹果12个SUPERMAN类基因成对高度同源,具有生物学功能的多样性,为深入的基因鉴定和遗传转化提供有用信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱元娣	中国农业大学农学与生物技术学院果树系	29	443	10.0	20.0
2	张文	中国农业大学农学与生物技术学院果树系	88	1395	19.0	35.0
3	李皓	中国农业大学农学与生物技术学院果树系	6	76	4.0	6.0
4	赵旭勉	中国农业大学农学与生物技术学院果树系	2	16	2.0	2.0
5	任雪芹	中国农业大学农学与生物技术学院果树系	6	30	3.0	5.0