登革病毒中国株E基因重组的生物信息学分析

• 作者: 刘利成 方美玉 涂增 白志军 陈唯军
• 来源期刊: 重庆医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: RDP3 登革热 E基因 遗传重组
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 67-70
• 分类号: R373.3
• 字数: 3024字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-3626.2012.01.019

摘要

目的:了解我国登革病毒(Dengue virus,DV)包膜蛋白基因(Envelope,E)重组的发生情况.方法:从GenBank收集共70个DV中国株的E基因序列,Clustal-W比对后,重组检测软件包RDP3检测E基因中可能存在的重组事件,并经Mega4构建系统发生树验证所检测的重组事件的可靠性和真实性.结果:DV-1型中E基因区存在3个重组事件,共4个重组子,分别是1995、1997、1999年和2004年分离的DV病毒株,在其它3个血清型的DV病毒株中没有检测到重组,也未检测到血清型间重组.结论:我国DV 1型血清型E基因区域存在基因重组.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈唯军	中国科学院北京基因组研究所	9	71	4.0	8.0
2	涂增	重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室	9	4	1.0	2.0
3	刘利成	中国科学院北京基因组研究所	1	4	1.0	1.0
4	白志军		1	4	1.0	1.0
5	方美玉		1	4	1.0	1.0