hsa-miR-100的生物信息学分析

• 作者: 付海龙 史春梅 季晨博 徐广峰 赵亚萍 郭锡熔
• 来源期刊: 国际检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 微RNAs hsa-miR-100 生物信息学 靶基因 肿瘤
• 年，卷（期）: 2012,（18）
• 所属期刊栏目: 基础实验研究论著
• 页码范围: 2177-2180
• 分类号: R730.2
• 字数: 2355字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4130.2012.18.001

摘要

目的 对hsa-miR-100进行靶基因、功能预测等生物信息学分析,为深入研究hsa-miR-100功能提供理论和试验基础.方法 利用Pubmed检索miRNA-100相关文章,通过miRBase、NCBI、UCSC Browser等在线工具分析hsa-miR-100序列,应用miRanda、TargetScan及PicTar预测hsa-miR-100靶基因,结合已证实的靶基因进行功能富集分析和信号通路富集分析.结果 hsa-miR-100与多种肿瘤发生、发展有关,其序列在各物种间具有高度保守性.hsa-miR-100靶基因功能富集于基因沉默、染色质沉默、细胞生物合成负性调节等(P<0.01),涉及肿瘤信号通路、溶酶体信号通路、凋亡信号通路等信号转导通路(P<0.05).结论 hsa-miR-100可能参与肿瘤发生相关的生物学过程.