草莓SBP基因家族生物信息学初步分析

• 作者: 宋长年 张希 张春华 葛安静 董清华 赵密珍
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓 拟南芥 SBP基因家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（13）
• 所属期刊栏目: 园艺-研究报告
• 页码范围: 215-220
• 分类号: S668.4
• 字数: 3027字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6850.2012.13.041

摘要

为了研究草莓SBP基因家族的功能,利用多种生物信息学软件,对SBP蛋白序列的系统发生和基因组定位进行分析,对其氨基酸组成成分、理化性质以及二、三级结构进行分析和预测等.结果表明草莓16条SBP蛋白序列与拟南芥16条SBP蛋白序列一起分成了3个亚族,说明拟南芥与草莓SBP基因间具有较高的保守性.基因组定位发现16个SBP基因分布在6条染色体上.研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异,而它们的二级结构主要以随机卷曲为主,三级结构相似.SBP基因家族在植物的生长、发育等多个方面起重要作用,笔者实验结果为草莓SBP基因家族的进一步功能分析提供了重要研究基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵密珍	江苏省农业科学院园艺研究所	123	1382	20.0	32.0
2	宋长年	南京农业大学园艺学院	40	502	16.0	21.0
3	董清华	北京农学院植物科学技术学院	33	339	12.0	17.0
4	张希	北京农学院植物科学技术学院	3	5	2.0	2.0
5	葛安静	北京农学院植物科学技术学院	5	64	3.0	5.0
6	张春华	江苏省农业科学院园艺研究所	7	45	4.0	6.0