苹果SBP基因家族生物信息学分析

• 作者: 上官凌飞 刘更森 张玉刚 慕茜 戴洪义
• 来源期刊: 江西农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 SBP基因家族 氨基酸序列 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 园艺园林
• 页码范围: 23-27
• 分类号: S661.1
• 字数: 3659字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-8581.2011.12.007

摘要

首先利用生物信息学方法对苹果42条SBP蛋白序列的系统发生和SBP基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了苹果与拟南芥的SBP基因家族之间的联系.结果显示着42条蛋白序列与拟南芥16条SBP蛋白序列一起被分成了7个亚族,拟南芥与苹果SBP基因间具有较高的保守性.基因组定位结果显示42条SBP基因分布在12条染色体上.研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列疏水性存在一定的差异；二级结构预测分析发现,42条氨基酸序列以随机卷曲和α-螺旋为主要组成部分,而且42条氨基酸序列三维结构相似.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	上官凌飞	南京农业大学园艺学院	37	426	13.0	20.0
2	张玉刚	青岛农业大学园林园艺学院	55	384	11.0	17.0
3	戴洪义	青岛农业大学园林园艺学院	88	585	13.0	20.0
4	刘更森	青岛农业大学园林园艺学院	28	296	9.0	16.0
5	慕茜	南京农业大学园艺学院	14	165	9.0	12.0