DNA序列映射方法对蛋白质编码区预测准确率的影响

• 作者: 张成 李琦 杨婷 杨泽林 马玉韬
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 预测准确率 蛋白质编码区 映射方法 加窗 窄通带滤波器
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 3234-3238
• 分类号: Q523
• 字数: 4848字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2012.06.008

摘要

[目的]探讨当前主要的DNA序列映射方法对蛋白质编码区的预测准确率的影响,寻找有效的映射方法.[方法]以AC(Approximate Correlation)为碱基层的预测准确率的测度,采用FIR( Finite Impulse Response)窄通带滤波器预测算法研究各种映射方法对预测准确率的影响.[结果]在ALLSEQ和HMR195 2个DNA序列集上,Voss法和Z-curve方法是较PN(Paired Numeric)法、EIIP( Electron-Io Interaction Potential)法和复数法更为有效的映射方法.[结论]该研究结果为用预测结果的AC值来验证新映射方法的有效性奠定了基础,对利用生物信息学方法正确揭示DNA序列的结构具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨泽林	宁夏大学物理电气信息学院	37	178	9.0	11.0
2	张成	宁夏大学物理电气信息学院	28	127	8.0	10.0
3	马玉韬	宁夏大学物理电气信息学院	4	33	4.0	4.0
7	李琦	宁夏大学物理电气信息学院	3	15	2.0	3.0
8	杨婷	宁夏大学物理电气信息学院	7	17	2.0	4.0