基于系统发育树的乳铁蛋白相互作用蛋白的预测

• 作者: 庞莉莉 郑文岭 钮冰 马文丽 黄俊逸
• 来源期刊: 北京生物医学工程
• 学科: 医学
• 关键词: 乳铁蛋白 系统发育 蛋白互作 系统进化树
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 53-57
• 页数: 5页
• 分类号: R318.04
• 字数: 3028字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-3208.2013.01.11.

摘要

目的 利用MEGA5.05软件构建乳铁蛋白及与其相互作用蛋白的系统发育树,以进一步寻找与乳铁蛋白相互作用的蛋白质.方法 将乳铁蛋白序列及与其相互作用的蛋白质序列以FASTA格式载入MEGA5.05软件,进化树生成算法采用邻接法,校验次数为1000次,其他参数为缺省数值,生成系统进化树.结果 与乳铁蛋白相互作用的蛋白质和乳铁蛋白之间有一定的同源关系,与乳铁蛋白相互作用的蛋白质之间也有一定的同源关系.结论 通过MEGA5.05软件构建系统发育树,可以预测出乳铁蛋白与肌红蛋白、载脂蛋白D、谷氨酰胺合酶可能存在相互作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马文丽	上海大学生命科学学院	39	300	7.0	16.0
2	郑文岭	上海大学生命科学学院	41	311	8.0	16.0
3	黄俊逸	上海大学生命科学学院	33	143	7.0	10.0
4	钮冰	上海大学生命科学学院	26	27	3.0	4.0
5	庞莉莉	上海大学生命科学学院	5	10	1.0	3.0