生物信息学分析及预测长链非编码RNA MALAT1的分子调控网络

• 作者: 何金花 朱剑霞 李秋娴 杨晓燕 韩泽平 黎毓光
• 来源期刊: 医学分子生物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 长链非编码RNA 乳腺癌 生物学信息 人类肺腺癌转移相关转录本1
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 73-79
• 页数: 7页
• 分类号: Q7
• 字数: 919字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3870/j.issn.1672-8009.2013.02.003

摘要

目的 运用在线数据库对长链非编码RNA MALAT1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)进行生物信息学分析,并进一步推测其分子调控网络.方法 运用多个在线数据库,预测并筛选MALAT1的上游转录因子、下游miRNA 及其靶基因,筛选出均与其相关的疾病,进一步研究在该疾病中MALAT1的核心调控网络.结果 通过预测及筛选,以乳腺癌为研究对象,MALAT1受上游转录因子snail、sox-5、FOXQ1和RUNX1的调控,同时又可调控下游hsa-miR-320a的表达;而hsa-miR-320a的预测靶基因为CCR7、PTEN和FADD,它们又可与MALAT1的转录因子相互作用,形成了一个调控环路.结论 对MALAT1分子调控网络生物信息学的分析可有助于理解其在乳腺癌发生与发展中的作用机制并为后续实验提供良好的指导依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何金花	广东省广州市番禺区中心医院检验科	16	66	5.0	7.0
2	黎毓光	广东省广州市番禺区中心医院检验科	11	45	4.0	6.0
3	韩泽平	广东省广州市番禺区中心医院检验科	11	31	4.0	4.0
4	朱剑霞	广东省广州市番禺区中心医院检验科	5	10	2.0	3.0
5	杨晓燕	广东省广州市番禺区中心医院检验科	4	6	2.0	2.0
6	李秋娴	广东省广州市番禺区中心医院检验科	3	3	1.0	1.0