8种植物CHI基因的生物信息学分析

• 作者: 付海辉 原晓龙 周军 孟富宣 董娇 辛培尧
• 来源期刊: 西南林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 查尔酮异构酶 生物信息学分析 蛋白质功能预测
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 88-95
• 页数: 8页
• 分类号: S718.46
• 字数: 6707字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1914.2013.02.018

摘要

根据GenBank上已登录的拟南芥、苹果杂交种、草莓、桃、沙梨的栽培种美人酥、葡萄、柑橘和玉米的查尔酮异构酶基因蛋白质氨基酸残基序列,应用生物软件对其组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性与亲水性、蛋白质二级和三级结构以及功能域进行预测和分析.结果表明:8种植物的CHI不具有导肽,不存在信号肽,不具有跨膜结构,推测CHI可能定位于细胞质基质中发挥功能,多肽链总体表现为亲水性；有α-螺旋、β-转折、无规则卷曲和延伸链4种二级结构,除了无规则卷曲是桃的最主要二级元件外；其余7种植物均是α-螺旋为最主要的结构元件；8种植物可能均有1个查尔酮异构酶活性部位.