甘蔗葡聚糖酶ScBG1基因的电子克隆及序列分析

• 作者: 游倩 罗俊 苏亚春 薛扳佟 郭晋隆 阙友雄
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 甘蔗 β-1,3-葡聚糖酶基因 电子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 页码范围: 80-90
• 页数: 11页
• 分类号: Q785
• 字数: 6490字
• 语种: 中文

摘要

为了揭示甘蔗β-1,3-葡聚糖酶基因的结构特点和功能特性，从而为该基因的研究和应用提供基础。以水稻β-1,3-葡聚糖酶基因(U72255.1)为搜寻探针，运用电子克隆技术，获得一条甘蔗β-1,3-葡聚糖酶基因全长cDNA，命名为ScBG1，并对其进行生物信息学分析。结果表明：该基因的cDNA序列全长为1842 bp，包含一个1488 bp完整的开放读码框，编码495个氨基酸残基，属于糖基水解酶第十七家族，为疏水性蛋白，含有信号肽。将ScBG1与其他植物种的β-1,3-葡聚糖酶基因进行序列比对，发现该基因具有保守和典型的葡聚糖酶结构域，碱基序列的保守性为45%~73%。研究结果为该基因的实验克隆奠定基础，也为甘蔗β-1,3-葡聚糖酶基因的分子功能研究提供参考。