鹅ATP5E基因cDNA克隆及生物信息学分析

• 作者: 何桦 刘贺贺 潘志雄 王浩瀚 王继文
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: ATP5E 克隆 生物信息学分析 鹅
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 5-9
• 页数: 5页
• 分类号: S835.2
• 字数: 3610字
• 语种: 中文

摘要

线粒体ATP酶合成体ε亚基(ATP synthase,H+transporting,mitochondrial F1 complex,epsilon,ATP5E)是ATP合成酶催化中心的最小亚基,在能量代谢过程中具有重要作用.本研究利用RT-PCR和RACE技术获得鹅ATP5E序列,并结合生物信息学方法对鹅ATP5E的序列进行深入分析.结果表明:克隆获得鹅ATP5E基因序列全长为347 bp,包括156 bp的编码区序列,编码51个氨基酸.同源性分析发现,鹅ATP5E核苷酸序列与推测氨基酸序列与原鸡的同源性最高,分别达到87.74％和89.58％,而与其他物种之间的一致性差异稍大.氨基酸序列分析发现该基因编码蛋白理论分子量为水溶性蛋白,相对分子量为5.79 ku,理论等电点为10.01,无信号肽序列和跨膜区,预测含有4个磷酸化位点,二级结构以α螺旋为主,预测ATP5E蛋白主要在能量代谢和脂肪酸代谢过程中有着关键作用.以上研究为进一步探讨ATPSE基因在鹅肝脂肪变性过程中的功能研究奠定了信息基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王浩瀚	四川农业大学动物遗传育种研究所	6	3	1.0	1.0
2	王继文	四川农业大学动物遗传育种研究所	125	673	13.0	21.0
3	何桦	四川农业大学动物遗传育种研究所	12	21	3.0	4.0
4	潘志雄	四川农业大学动物遗传育种研究所	12	25	3.0	4.0
5	刘贺贺	四川农业大学动物遗传育种研究所	22	47	5.0	6.0