URI1蛋白生物信息学分析及在人体组织中的表达

• 作者: 乔龙威 冉德园 吕耀娟 李晓云 梁玉婷 谷俊侠 郑其平
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 非经典前折叠素RPB5相互作用因子1 变异体 生物信息学 表达
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 基础实验诊断研究
• 页码范围: 672-675
• 页数: 4页
• 分类号: R857.3|R33
• 字数: 3266字
• 语种: 中文

摘要

目的 分析人非经典前折叠素RPB5相互作用因子1(URI1)蛋白的特性、结构和变异体,观察URI1蛋白在人组织中的表达.方法 通过多种网络分析工具,预测和分析URI1的基本特性及结构.用人组织微阵列免疫组化染色方法检测其在多种组织/细胞中的表达.结果 URI1编码1个535个氨基酸的蛋白质,该蛋白质性质不稳定,无跨膜片段,N末端无信号肽,非分泌型蛋白质,其mRNA在组织中广泛表达.URI1具有11个潜在的泛素化位点,其中6个为高度可信,5个为中度可信.有48个潜在的磷酸化位点(35个在丝氨酸位、11个在苏氨酸位、2个在酪氨酸位).在第287氨基酸位有一糖基化位点,在第291、371氨基酸位也可能发生糖基化修饰,未发现乙酰化位点.蛋白质结构预测α螺旋(H)占39.63％,N端具有1个PFD功能域.URI1在多种组织/细胞广泛表达并存在明显差异表达,与基于高密度微阵列技术的BioGPS mRNA表达谱数据吻合.结论 用生物信息学技术预测了URI1蛋白的结构和功能,为URI1蛋白的相关研究提供了信息.