微生物全基因组测序组装中的gap填补方法

• 作者: 周育森 张志毅 童贻刚 范航 黄勇
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 测序 组装 gap填补
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 819-821
• 页数: 3页
• 分类号: Q8121.4|Q78
• 字数: 1719字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2013.06.015

摘要

目的：研究和开发高通量测序全基因组组装过程中的填补gap的方法。方法：研究组装软件的算法，使用Perl语言编写自动填补gap的程序，并建立全基因组组装的流程。结果：提出了填补gap的末端延伸法，并使用Perl语言进行了编程；在对立克次体高通量测序的组装过程中，这些方法能大大减少gap的数量。结论：本研究提出的末端延伸法能够高效填补全序列组装过程中出现的gap，具有很强的实用性。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	童贻刚	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	58	363	11.0	17.0
2	周育森	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	75	354	8.0	16.0
3	张志毅	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	8	41	3.0	6.0
4	黄勇	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	5	20	3.0	4.0
5	范航	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	6	15	2.0	3.0