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砀山酥梨萼片发育的SSH文库构建及EST序列分析
砀山酥梨萼片发育的SSH文库构建及EST序列分析
作者:
朱立武
贾兵
贾胜
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
砀山酥梨
萼片
抑制差减杂交技术
SSH文库
序列分析
摘要:
为了寻找梨幼果期萼片发育中差异表达基因,为梨幼果萼片脱落分子机制研究提供依据,以砀山酥梨萼片脱落开始期幼果为材料,利用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建砀山酥梨幼果期宿萼果与脱萼果差异表达cDNA文库.随机挑取200个阳性克隆,经菌液PCR检测及测序后得到185个EST序列片段, 其中小于100 bp、大于300 bp以及介于两者之间的EST片段分别占3%、96%和1%.将这些片段在NCBI上进行BLAST比对,得到调节因子(regulator)、蛋白质(protein)和相关酶类(related enzyme)3类代谢途径相关物质,分别占21%、63%和16%.其中,在Gene Ontology网站上比对到3-异丙基苹果酸脱氢酶(3-isopropylmalate dehydrogenase)和N-酰基-L-氨基酸氨基水解酶(N-acyl-L-amino acid amidohydrolae)2种酶,推测可能是砀山酥梨幼果期萼片发育代谢途径中的重要的相关酶.
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文献信息
篇名
砀山酥梨萼片发育的SSH文库构建及EST序列分析
来源期刊
安徽农业大学学报
学科
农学
关键词
砀山酥梨
萼片
抑制差减杂交技术
SSH文库
序列分析
年,卷(期)
2013,(3)
所属期刊栏目
园艺
研究方向
页码范围
454-459
页数
分类号
S661.2
字数
语种
中文
DOI
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作者信息
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姓名
单位
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被引次数
H指数
G指数
1
贾兵
安徽农业大学果树学重点实验室
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2
朱立武
安徽农业大学果树学重点实验室
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贾胜
安徽农业大学果树学重点实验室
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砀山酥梨
萼片
抑制差减杂交技术
SSH文库
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
安徽农业大学学报
主办单位:
安徽农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1672-352X
CN:
34-1162/S
开本:
大16开
出版地:
合肥市长江西路130号
邮发代号:
创刊时间:
1957
语种:
chi
出版文献量(篇)
3481
总下载数(次)
11
总被引数(次)
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