刺五加Actin基因cDNA全长序列的克隆与生物信息学分析

• 作者: 修乐山 周秘 柴丽花 邢朝斌
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 学科: 医学
• 关键词: 刺五加 肌动蛋白 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 中药研究
• 页码范围: 1901-1906
• 页数: 6页
• 分类号: R284.1
• 字数: 4081字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.2013.09.007

摘要

目的：克隆刺五加Actin基因的全长cDNA序列，并对其进行生物信息学分析。方法：以刺五加的叶片为材料，提取总RNA，逆转录为cDNA，根据初步克隆到的刺五加Actin基因保守序列设计引物，利用套式PCR进行3'和5'RACE扩增，得到Actin基因的3'和5'端cDNA序列片段，拼接获得cDNA全长。将该序列进行BLAST比对、相似度分析，并对刺五加Actin1蛋白的二级结构和三级结构进行预测。结果：刺五加的Actin基因全长1507 bp，命名为ESA ctin1，注册号KC469585。该基因开放阅读框（ORF）长1134 bp，编码377个氨基酸，5'端非编码区长140 bp，3'端非编码区长233 bp。ESActin1与GenBank 中注册的其它植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性在75%以上，蛋白质序列的相似性在94%以上。结论：首次报道了刺五加Actin基因的全长cDNA序列，为刺五加的分子生物学研究奠定基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邢朝斌	河北联合大学生命科学学院	56	376	11.0	16.0
2	修乐山	河北联合大学生命科学学院	24	132	8.0	10.0
3	柴丽花	河北联合大学生命科学学院	6	21	3.0	4.0
4	周秘	河北联合大学生命科学学院	16	78	6.0	8.0