基于复合EST-SSR标记的大白菜种子纯度鉴定及SNP位点获取

• 作者: 兰青阔 刘娜 朱珠 李欧静 王永 贺长征 赵新 郭永泽 陈锐
• 来源期刊: 中国蔬菜
• 学科: 农学
• 关键词: 大白菜 种子 纯度鉴定 复合EST-SSR SNP
• 年，卷（期）: 2013,（14）
• 页码范围: 31-38
• 页数: 8页
• 分类号: S634.1
• 字数: 4997字
• 语种: 中文

摘要

以10份大白菜杂交种及其亲本为研究对象，基于NCBI基因组数据库中EST序列信息，应用SSR标记及高分辨率溶解曲线技术筛选出用于大白菜杂交种纯度鉴定的SNP位点及复合SSR位点，并根据高通量分子检测技术种子纯度鉴定的需要，对单粒种子育苗条件、单株植株提取状态、快速DNA提取方法、复合PCR体系的建立等关键技术进行了摸索及优化。结果显示：经过48 h破壳状态的单粒种子，采用改良CTAB法可于3 h内得到较高质量的DNA；同时经7 d达到苗期状态的单株叶片，采用chexe-100法亦可于40 min内完成DNA提取；筛选得到的SNP位点可对6份大白菜杂交种进行纯度鉴定，复合SSR位点可对10份大白菜杂交种进行纯度鉴定。