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苹果NADP依赖的苹果酸酶基因克隆、序列和表达分析
苹果NADP依赖的苹果酸酶基因克隆、序列和表达分析
作者:
余贤美
安淼
王海荣
王长君
董庆龙
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
苹果
苹果酸酶
克隆
序列分析
表达分析
摘要:
[目的]克隆苹果(Malus ×domestica B.)中苹果酸代谢的关键酶基因MdNADP-ME,进行序列特征分析,研究MdNADP-ME在苹果中组织表达的情况.[方法]利用RT-PCR技术获得苹果MdNADP-ME1,2,3全长的cDNA序列.对该序列进行生物信息学分析,采用荧光实时定量PCR技术研究MdNADP-ME1,2,3的组织表达.[结果]测序结果显示,获得的3个NADP-苹果酸酶基因(MdNADP-ME1、MdNADP-ME2和MdNADP-ME3; GenBank登录号为JX971883、JX971884和JX971885),其0RF分别为1 512、1 782和1 926 bp,推测其分别编码503、593和641个氨基酸的多肽.氨基酸序列和结构分析显示,这3个基因均含有5个保守的氨基酸区域(motif I-V),含有2个功能结构域:malic和NAD_bind_1_malic_enz.进化树分析结果显示,MdNADP-ME1和MdNADP-ME2属于双子叶植物细胞质NADP-ME型,MdNADP-ME3属于双子叶植物质体NADP-ME型.荧光实时定量PCR结果表明,MdNA DP-ME1-3在被检测的组织中均有表达,但表达差异明显.[结论]MdNADP-ME1-3属于植物NADP-ME家族,结构高度保守,并且在苹果的不同组织中有不同表达模式.
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文献信息
篇名
苹果NADP依赖的苹果酸酶基因克隆、序列和表达分析
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
苹果
苹果酸酶
克隆
序列分析
表达分析
年,卷(期)
2013,(9)
所属期刊栏目
园艺
研究方向
页码范围
1857-1866
页数
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2013.09.013
五维指标
作者信息
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姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王长君
60
237
8.0
13.0
2
安淼
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3
王海荣
29
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7.0
10.0
4
余贤美
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252
8.0
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5
董庆龙
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节点文献
苹果
苹果酸酶
克隆
序列分析
表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
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