蛇足石杉1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶（）基因克隆与表达分析＊

• 作者: 何柳 孙超 宋经元 李标 李榕涛 林余霖 罗红梅 胡志刚
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 学科: 医学
• 关键词: 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶 蛇足石杉 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 页码范围: 342-348
• 页数: 7页
• 分类号: R282
• 字数: 4263字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.2013.03.002

摘要

基于本实验室已获得的蛇足石杉转录组数据，获得一个编码1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶（1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase，DXR）的转录本，分析其开放阅读框序列，发现该转录本编码全长为1440 bp的蛇足石杉DXR基因（HsDXR1），含有479个氨基酸残基。采用RT-PCR方法获得了HsDXR1全长，并对HsDXR1编码蛋白的理化性质、结构域及三维结构进行预测分析。结果显示HsDXR1编码蛋白的预测分子量为51.4961 kDa，等电点为6.44；不含信号肽和跨膜区；亚细胞定位预测表明该蛋白最可能定位于叶绿体；具有DXR蛋白典型的结构域。实时荧光定量PCR检测HsDXR1基因在蛇足石杉的茎中表达量最高，其次为根，在叶中表达量最低。本研究获得了蛇足石杉HsDXR1基因的编码区序列，为进一步研究HsDXR1在蛇足石杉萜类化合物生物合成途径中的功能奠定基础。