盐芥EhKCR1基因的克隆及表达分析

• 作者: 冯金朝 周宜君 安会灵 徐小静 韦百阳
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 盐芥 EhKCR1 电子克隆 生物信息学分析 Real-time PCR
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 55-62
• 语种: 中文

摘要

以山东生态型盐芥(Eutrema halophilum)为试材,采用电子克隆及RT-PCR的方法,从中获得一个p-酮脂酰-CoA还原酶基因全长cDNA,命名为EhKCR1,GenBank登录号为JQ389855.EhKCRl cDNA长1 152 bp,含954 bp开放阅读框架,编码318个氨基酸.采用生物信息学的手段对EhKCR1蛋白的保守结构域、疏水性和二级结构等进行了分析.EhKCR1蛋白具有NADH结合结构域[G (X) 3GXG (X) 3A (X) 3A (X) 2G]负责裂解的关键结构域[Y(X)3K].序列比对和系统进化分析表明,盐芥EhKCRl基因与来源于拟南芥和油菜的KCR1亲缘关系最近,与单子叶植物来源的KCR1亲缘关系较远.Real-time PCR分析表明EhKCR1受ABA和干旱明显诱导.推测EhKCR1与盐芥的抗逆有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯金朝	中央民族大学生命与环境科学学院	176	1868	22.0	37.0
2	徐小静	中央民族大学生命与环境科学学院	14	35	3.0	5.0
3	周宜君	中央民族大学生命与环境科学学院	126	1498	20.0	33.0
4	安会灵	中央民族大学生命与环境科学学院	3	4	1.0	1.0
5	韦百阳	中央民族大学生命与环境科学学院	2	6	1.0	2.0