脑心肌炎病毒多聚蛋白编码区起始与终止区的密码子使用模式

• 作者: 孙晓林 张峰 张瑜 王树瑜
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 脑心肌炎病毒 翻译起始区 翻译终致区 密码子使用模式
• 年，卷（期）: 2013,（22）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 9202-9204
• 页数: 3页
• 分类号: S852.65
• 字数: 3787字
• 语种: 中文

摘要

文中利用特定区域密码子使用偏嗜性对数公式分析了脑心肌炎病毒(Encephalomyocarditis virus,EMCV)多聚蛋白编码基因的翻译起始区域与翻译终止区域的密码子使用模式.结果表明,EMCV多聚蛋白编码区内翻译起始序列区的同义密码子使用偏嗜性的正负偏差总体是平衡的,但几种在整体多聚蛋白质编码区域内使用为负偏嗜的稀有密码子却倾向于出现于编码起始区和终止区.这一有趣的现象,可利用“稀有密码子调控假说”来解释为EMCV开放阅读框两端的稀有密码子偏好性使用对整体阅读框的表达具有负调控作用.该研究说明“稀有密码子调控假说”不仅适用于细菌,而且也适用于一些RNA病毒基因组.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙晓林	甘肃农业大学动物医学院	45	108	5.0	8.0
2	张峰	甘肃农业大学动物医学院	14	258	7.0	14.0
3	张瑜	甘肃农业大学动物医学院	8	34	4.0	5.0
5	王树瑜	甘肃农业大学动物医学院	4	8	1.0	2.0