抑制剂Amprenavir与HIV-2蛋白酶作用机制的分子动力学研究

• 作者: 伊长虹 张少龙 张庆刚 梁志强 王伟 程伟渊 陈建中
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: HIV-2蛋白酶 分子动力学 分子力学/泊松-波尔兹曼表面积方法 结合自由能
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 47-54
• 页数: 8页
• 分类号: Q61
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2014.30162

摘要

HIV-2蛋白酶已成为治疗艾滋病的一个重要药物靶标.作者采用分子动力学模拟并结合自由能计算,研究了抑制剂Amprenavir (AMP)与HIV-2蛋白酶的作用机制.研究结果表明范德华作用是AMP与HIV-2蛋白酶结合的主要力量.采用基于残基的自由能分解方法计算抑制剂-残基相互作用,结果表明疏水性的CH-π和CH-O相互作用驱动了抑制剂AMP与HIV-2蛋白酶的结合.作者期望这一研究结果能为抗艾滋病双重抑制剂的研发提供一定的理论指导.