奥尔森派琴虫和北海派琴虫ITS基因测序及同源性分析

• 作者: 杨俊萍 郭书林 陈信忠 陈垚 龚艳清
• 来源期刊: 检验检疫学刊
• 学科: 农学
• 关键词: 奥尔森派琴虫 北海派琴虫 ITS基因 同源性分析
• 年，卷（期）: zlaqyjyjc_2014,（1）
• 页码范围: 62-67
• 页数: 6页
• 分类号: S944.4

摘要

通过设计能扩增奥尔森派琴虫和北海派琴虫ITS序列的特异性引物，对我国东南沿海8个地区养殖牡蛎中常见的两种派琴虫相应基因进行扩增、克隆和测序，并进行同源性分析。国内不同地区奥尔森派琴虫ITS序列的同源性超过99-3％，与国外分离株的同源性也在98．8％以上；种间同源性分析发现，奥尔森派琴虫与海水派琴虫和Phonshuensis的同源性较高，分别为94．2％和95．0％，与Pqugwadiif7同源性最低，仅62．9％。深圳和三亚分离的北海派琴虫ITS序列有18个碱基存在差异，其中ITS．1有3个碱基差异，ITS．2有15个碱基差异，而5．8S高度保守，没有碱基差异；北海派琴虫与其他种类之间的差异主要表现在ITS-1和ITS-2区域；同源性比较发现，北海派琴虫的同源性在100％-97．9％之间，其中深圳北海派琴虫的同源性较低，为97．9％。种间同源性分析表明，北海派琴虫与奥尔森派琴虫的同源性较高，为89．4％，其次为海水派琴虫和Phonshuensis，与Pqugwadi同源性最低，仅71．9％。