ASIP蛋白与AgRP相关蛋白生物信息比较分析

• 作者: 周荣艳 李兰会 李祥龙 杨清芳 马建青
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: Agouti ASIP AgRP 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 9-14,20
• 页数: 7页
• 分类号: S811.6
• 字数: 3881字
• 语种: 中文

摘要

利用生物信息学的方法研究人、绵羊和牛等18个物种Agouti信号蛋白(ASIP)和Agouti相关蛋白(AgRP)的编码区及其对应氨基酸序列的相关特征,以期探明两种蛋白的遗传分化特点.结果表明,在ASIP与AgRP均为399bp的CDS序列中,其核苷酸保守区域的位置分别在262～399 bp和230～399 bp处;ASIP和AgRP在各自CDS序列多态位点变异的各项指标数值及其百分率大小上均极为接近;在46条ASIP的CDS序列及32条AgRP的CDS序列中,二者的单倍型数分别为22种和23种,ASIP和AgRP在基因的进化以及不同物种的遗传分化上具有相似性;两者的氨基酸序列在98～140 aa片段处保守性较高,该区域同时富含半胱氨酸(Cys);ASIP和AgRP一级结构的理化性质表现为共性与差异并存;二者的肽链C端具有相似的三维结构,但各自也具有其结构特异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李兰会	河北农业大学动物科技学院	120	583	13.0	17.0
2	周荣艳	河北农业大学动物科技学院	105	307	9.0	11.0
3	马建青	河北农业大学动物科技学院	2	3	1.0	1.0
4	杨清芳		1	1	1.0	1.0