草鱼α-淀粉酶基因5＇侧翼序列克隆与分析

• 作者: 帅方敏 朱书礼 李捷 李新辉 李琳 李跃飞 杨计平
• 来源期刊: 南方水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 草鱼 α-淀粉酶基因 Genome Walking 5'侧翼序
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 页码范围: 87-93
• 页数: 7页
• 分类号: Q953
• 字数: 5178字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-0780.2014.05.013

摘要

应用PCR和Genome Walking技术克隆获得长度为168 bp的草鱼（ Ctenopharyngodon idellus）α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列和2063 bp的5＇侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列比对，相似度为68%~86%。将草鱼α-淀粉酶基因5＇侧翼序列进行生物信息学分析，确定了其转录起始区域及转录起始位点（ TSS）；在TSS上游30 bp处有1个TATA-box，-58 bp处有CCAAT-box；在5＇侧翼序列中还发现有GATA-1、OCT-1、GR、HNF-3、AP1和SP1等转录因子结合位点。草鱼α-淀粉酶基因5＇侧翼序列的克隆，为进一步研究不同食性鱼类α-淀粉酶基因侧翼序列的差异、鱼类α-淀粉酶基因的表达、功能及调控机理奠定基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李新辉	中国水产科学研究院珠江水产研究所	53	572	15.0	20.0
2	帅方敏	中国水产科学研究院珠江水产研究所	12	43	4.0	6.0
3	李跃飞	中国水产科学研究院珠江水产研究所	24	162	8.0	12.0
4	杨计平	中国水产科学研究院珠江水产研究所	8	26	4.0	5.0
5	朱书礼	中国水产科学研究院珠江水产研究所	7	23	3.0	4.0
9	李捷	中国水产科学研究院珠江水产研究所	27	247	9.0	15.0