二化螟 Ty3/gypsy 反转座子的克隆与序列分析

• 作者: 刘宝生 张志春 方继朝 李晓欢 罗光华
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 农学
• 关键词: 二化螟 反转座子 Ty3/gypsy 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 314-321
• 页数: 8页
• 分类号: Q785|S435.112+.1
• 字数: 6830字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7216.2014.03.011

摘要

转座子是宿主基因组的重要组成部分.Ty3/gypsy 反转座子是广泛存在于生物体内的一类反转座子.通过反向PCR(inverse PCR)和基因组步移方法成功地从二化螟体内获得一个具有完整结构的 Ty3/gypsy 反转座子拷贝,命名为Csu-Ty3(GenBank 登录号：KJ191261).该反转座子拷贝全长4934 bp,在基因组上插入的靶位点(target sit duplications, TSDs)是“AACGT”,两端的长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)不完全相同,5′端 LTR 长161 bp,3′端 LTR 长168 bp,两者的一致度为93．5％；在靠近3′端 LTR 处有一段长15 bp 的嘌呤尾(polypurine tract,PPT)序列.经 ORF Finder 分析,Csu-Ty3中包含三个独立的 ORF,从左至右第一个 ORF 编码类似病毒的结构蛋白,称为 GAG 蛋白；第二个 ORF 编码天冬氨酰蛋白酶(aspartic protease,AP)蛋白；第三个 ORF 编码一个多聚蛋白,包含反转录酶(reverse transcriptase,RT)、RNA酶 H(RNase H,RH)以及整合酶(integrase,IN).Southern 杂交显示二化螟不同地理种群中均有较多的 Csu-Ty3拷贝.在特定基因座位上,对 Csu-Ty3拷贝插入与否的检测结果显示,二化螟不同地理种群中在该位点上均含有 Csu-Ty3拷贝的插入,但在德阳和江津种群中有些个体在该位点上没有检测到 Csu-Ty3拷贝的插入.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方继朝	南京农业大学植物保护学院	80	747	15.0	22.0
3	刘宝生	江苏省农业科学院植物保护研究所	28	228	8.0	14.0
4	张志春	江苏省农业科学院植物保护研究所	12	48	3.0	6.0
5	罗光华	江苏省农业科学院植物保护研究所	9	13	2.0	2.0
8	李晓欢	南京农业大学植物保护学院	3	5	2.0	2.0