糖苷水解酶第10家族真菌木聚糖酶保守区及进化关系的分析

• 作者: 吴静 朱天地 殷欣 邬敏辰 龚燕燕
• 来源期刊: 中国生物制品学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 糖苷水解酶第10家族 真菌 木聚糖酶 保守区 进化
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 46-51
• 分类号: Q556+.2|Q349
• 语种: 中文

摘要

目的 对糖苷水解酶第10家族(glucoside hydrolase family 10,GHF10)真菌木聚糖酶保守区及进化关系进行分析.方法 应用CLUSTALW2软件对41条GHF10真菌木聚糖酶氨基酸序列进行多序列比对分析,获得完全保守的氨基酸位点;应用Block Maker和Consensus软件对CLUSTALW2比对结果进一步分析,确定第10家族真菌木聚糖酶共有的保守区及保守氨基酸位点;应用Pymol软件对源于GenBank中登录的6种10家族木聚糖酶进行比对,并找到这41条序列中共有的β折叠和α螺旋;利用MEGA 4.0软件对CLUSTALW2比对结果构建系统进化树,并根据进化树进行分组.结果 41条序列长度虽然不等,但均包含E270和E405两个谷氨酸催化位点.通过序列比对,得到第10家族真菌木聚糖酶的5个高度保守区TPENSMK、RGHTLVWHSQLPSWV、WDVVEN、AKLYINDYYNL、TELDI以及20个完全保守的氨基酸位点,这些保守区和保守位点多数分布在木聚糖催化区域以及(β/α)8折叠桶的内壁上.根据木聚糖酶的亲缘关系,可将第10家族真菌木聚糖酶分为3个大组,其中第1和第3组的木聚糖酶分别有12和27种,且均来源于子囊菌门;第2组仅包含2种木聚糖酶序列,来源于Neocallimastigomycota和担子菌门.结论 分析了GHF10真菌木聚糖酶的保守区及进化关系,为木聚糖酶的工程改造奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邬敏辰	江南大学无锡医学院	163	1504	22.0	29.0
2	吴静	江南大学无锡医学院	29	177	8.0	12.0
3	龚燕燕	江南大学药学院	4	31	4.0	4.0
4	殷欣	江南大学生物工程学院	12	66	6.0	7.0
5	朱天地	江南大学生物工程学院	3	8	2.0	2.0