利用微滴数字PCR分析转基因生物外源基因拷贝数

• 作者: 姜羽 杨立桃 胡佳莹
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 微滴数字PCR(ddPCR) 转基因生物(GMOs) 外源基因 拷贝数
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 研究资源与技术改进
• 页码范围: 1298-1305
• 页数: 8页
• 字数: 5706字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2014.10.013

摘要

微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)是一种基于泊松分布原理的核酸分子绝对定量技术,在核酸分子的绝对计数/定量领域具有极大的应用潜力.本研究基于ddPCR平台,以转基因水稻(Oryza sativa)T1c-19和转人乳铁蛋白基因基因山羊(Capra hircus) 134为例,建立了转基因生物(genetically modified organisms,GMOs)外源基因拷贝数分析方法,并比较了其与传统的实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)和Southern blot方法的准确性.实验数据表明,T1c-19的杀虫晶体蛋白基因(insecticidal crystal protein,Cry1C*)在qRT-PCR和ddPCR测定结果比较一致,约为2拷贝,但已报道的Southern blot分析结果为1拷贝;ddPCR对bar基因的分析结果高于qRT-PCR,分别为2.09拷贝和1.51拷贝.转人乳铁蛋白基因(human lactoferrin,HLF)山羊134在qRT-PCR和ddPCR的分析结果基本一致,均测得含有l拷贝的HLF基因.研究结果表明,微滴数字PCR方法是一种经济、快速和准确的外源基因拷贝数分析新方法,灵敏度和准确性高,将会在拷贝数分析中广泛应用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨立桃	上海交通大学生命科学技术学院	19	279	9.0	16.0
2	胡佳莹	上海交通大学生命科学技术学院	2	64	2.0	2.0
3	姜羽	上海交通大学生命科学技术学院	2	64	2.0	2.0