大熊猫和北极熊基因组微卫星分布特征比较分析

• 作者: 岳碧松 张修月 李午佼 李玉芝 杜联明 沈咏梅 黄杰
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 医学
• 关键词: 大熊猫 北极熊 基因组 微卫星
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 基础资料
• 页码范围: 874-878
• 页数: 5页
• 分类号: Q959.8|R857.3
• 字数: 4520字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7083.2014.06.012

摘要

本研究比较分析了大熊猫和北极熊全基因组序列中的1～6碱基重复的完美型微卫星序列的分布特征,通过微卫星序列搜索和统计软件MSDB分析分别得到855 018和936 238个微卫星序列,其长度总和分别是14 919 240 bp和18 434 348 bp;分别占基因组大小的0.64％和0.79％,大熊猫和北极熊基因组总丰度分别是371.8个/Mb和405.6个/Mb,二者基因组中微卫星都是单碱基重复的最多,其次是二碱基、四碱基、三碱基和五碱基,六碱基重复类型的数量最少.大熊猫和北极熊含量最丰富的重复拷贝类别主要有A、AC、AG、AAAT、AAAG、AT和C等.本研究为后续开发和筛选大量高质量的熊科物种微卫星标记提供了数据支持.