气单胞菌低温淀粉酶基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 宋素琴 张志东 楚敏 王玮 顾美英
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 气单胞菌属 低温淀粉酶 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（11）
• 页码范围: 2059-2065
• 页数: 7页
• 分类号: S188+.3
• 字数: 3835字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2014.11.016

摘要

[目的]获得低温菌LA77的低温淀粉酶基因及其生物学信息.[方法]用16S rDNA序列分析对其进行了分子鉴定,并根据分类地位进行了特异引物设计和PCR扩增,通过生物学网站和软件对获得的基因及编码蛋白进行分析.[结果]低温菌LA77归属于气单胞菌属,PCR扩增获得一条编码703个氨基酸的完整开放阅读框的基因.通过生物信息学分析显示该蛋白质理论分子量约为77.9 kD,等电点为6.16,为亲水、且具有信号肽的跨膜蛋白.可能存在10个磷酸化位点,1个糖基化位点,二级结构主要由α螺旋和随机卷曲构成.基于氨基酸序列的结构域和系统进化树分析表明,该蛋白属于α-淀粉酶家族,极可能为低温淀粉酶.[结论]LA77低温淀粉酶基因的获得,将为低温淀粉酶基因的进一步改造、表达以及其酶低温催化机理的阐释奠定重要的基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王玮	新疆农业科学院微生物应用研究所	24	130	6.0	10.0
2	顾美英	新疆农业科学院微生物应用研究所	34	205	8.0	13.0
3	张志东	新疆农业科学院微生物应用研究所	34	164	6.0	11.0
4	楚敏	新疆农业科学院微生物应用研究所	16	47	4.0	5.0
5	宋素琴	新疆农业科学院微生物应用研究所	19	150	6.0	11.0