基于松材线虫全基因组序列的SSR标记开发

• 作者: 刘云 叶建仁 吴小芹 许峻荣
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 松材线虫 全基因组序列 SSR标记 遗传多态性
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 36-42
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|S763.16
• 字数: 4898字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.2014.02.008

摘要

为了研究松材线虫在我国的群体遗传关系及传播路径，获得更为稳定的松材线虫分子标记，使用MISA软件对松材线虫全基因组10432条DNA片段进行搜索，共获得95个gSSR位点。其中，二核苷酸重复出现频率最高，占全部SSR位点的66?3％。依据所有gSSR位点共设计出36对引物，以1份松材线虫DNA pooling（包含我国46个不同地理来源的松材线虫虫株DNA）为模板进行PCR，产物由QIAxcel全自动凝胶电泳分析系统检测，获得17对可能具有多态性的gSSR引物。进一步对这17对引物的PCR产物进行单克隆试验并测序，BioEdit软件拼接比对结果表明，其中9对确实具有多态性。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴小芹	南京林业大学森林资源与环境学院江苏省有害生物入侵预防与控制重点实验室	179	1754	22.0	29.0
2	叶建仁	南京林业大学森林资源与环境学院江苏省有害生物入侵预防与控制重点实验室	226	2554	25.0	37.0
3	刘云	南京林业大学森林资源与环境学院江苏省有害生物入侵预防与控制重点实验室	8	12	2.0	3.0
4	许峻荣	南京林业大学森林资源与环境学院江苏省有害生物入侵预防与控制重点实验室	1	3	1.0	1.0