白菜硫代葡萄糖甙合成中MAM的进化分析

• 作者: 刘锦 张冀芳 梁建丽 武剑 王晓武 程锋
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 白菜 硫甙 白菜MAM 共线性 进化树
• 年，卷（期）: 2014,（21）
• 所属期刊栏目: 园艺?贮藏?保鲜?加工
• 页码范围: 4309-4317
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.21.016

摘要

目的探索硫代葡萄糖甙合成中关键基因-甲基硫代烷烃基苹果酸合成酶（methylthioalkylmalate， MAM）基因在白菜基因组中的进化情况，为研究白菜MAM的功能提供理论指导。方法根据白菜数据库BARD信息分析拟南芥、盐芥和白菜MAM的共线性关系，利用MEME在线软件预测MAM序列的高度保守基序（motif），通过R软件分析93份白菜材料MAM的表达模式，并利用MEGA5.05软件构建MAM的系统进化树。结果白菜的3个亚基因组均保留着MAM的同源基因。其中与拟南芥具有共线性的5个同源基因可能源自基因组古三倍化复制，其它两个同源基因可能是由转座扩增产生的；基序分析结果表明，与拟南芥的MAM相比，白菜的MAM同源基因存在基序的缺失，并且大多发生在序列的两端；在93份白菜材料中，白菜MAM同源基因之间的表达量有很大差异，Bra021947与Bra018524只在少数材料中存在极低的表达，并且Bra029356的表达量低于可检测水平；进化树分析发现，除Bra018524外，其他的白菜MAM同源基因与拟南芥的MAM聚集在不同的分支上。结论白菜的MAM可能在拟南芥和白菜物种分化之后独立起源并进化出不同的功能。