半夏凝集素基因的克隆、生物信息学分析及其蛋白的亚细胞定位

• 作者: 周永红 彭正松 赵欢 雷杨
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 半夏 半夏凝集素 基因克隆 瞬时表达 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2014,（13）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 1914-1919
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2014.13.020

摘要

目的 克隆半夏凝集素基因,并对其进行生物信息学分析和亚细胞定位.方法 以半夏Pinellia ternata新鲜叶片的DNA为模板,根据Genbank上的半夏凝集素的基因序列(GU593718.1)设计引物,克隆了半夏凝集素(PTA)基因,并构建植物表达载体pI 1300-CaMV35 S-PTA-GFP,在农杆菌GV3101中进行表达且观察了其在烟草中瞬时表达.结果 所克隆的PTA的开放阅读框为810 bp,其编码269个氨基酸;具有1条信号肽、2个B-lectin保守区域和3个甘露糖结合基序;PTA氨基酸序列与NCBI中所报道的半夏、掌叶半夏P.pedatisecta、滴水珠P.cordata凝集素的氨基酸序列的同源性分别达到97％、85％和83％;初步推测其定位于膜上,现已在NCBI中登记(登录号KF154979).结论 本实验通过对半夏凝集素的生物信息学分析和亚细胞定位分析,为进一步研究半夏凝集素的抗病虫害机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭正松	西华师范大学生命科学院	120	1353	21.0	29.0
2	周永红	四川农业大学小麦研究所	44	693	15.0	25.0
3	赵欢	四川农业大学小麦研究所	18	27	4.0	4.0
12	雷杨	四川农业大学水稻研究所	1	4	1.0	1.0