胃癌中P53诱导相关微小RNA靶基因预测及生物信息学分析

• 作者: 张玲玲 曹辉 白班俊 许钟
• 来源期刊: 重庆医学
• 学科: 历史
• 关键词: 胃肿瘤 基因,P53 微RNAs 计算生物学
• 年，卷（期）: 2014,（34）
• 所属期刊栏目: 论著?基础研究
• 页码范围: 4570-4573
• 页数: 4页
• 分类号: K735.2
• 字数: 1905字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2014.34.004

摘要

目的：利用生物信息学预测胃癌中 P53诱导相关微小 RNA（miRNA）的靶基因及功能。方法通过胃癌的限定，用在线数据库mir2disease、Gene Expression Atlas缩小目的基因范围。利用在线预测软件miRNA 靶基因数据库 miRGen（v3．0）预测目标miRNA的靶基因。通过在线软件DAVID和Pathway Miner对预测的靶基因数据集进行功能富集和信号转导通路分析。结果胃癌中P53诱导相关miRNA包括miR-21、miR-25、miR-103等，预测miR-21靶基因共1090个，其中在胃癌中下调共115个；Pathway Miner分析显示miR-21的靶基因涉及黏附连接、胰岛素信号转导通路、细胞凋亡、钙信号转导通路、JAK-STAT信号转导途径等。结论 miR-21靶基因涉及多个肿瘤发生、发展相关信号通路。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张玲玲	贵州省人民医院消化内科	16	59	5.0	7.0
2	白班俊	贵州省人民医院消化内科	19	143	8.0	11.0
3	曹辉	贵州省人民医院肿瘤科	12	48	4.0	6.0
4	许钟	贵州省人民医院消化内科	10	41	3.0	6.0