牙鲆(Paralichthys olivaceus) Activin 基因两种β亚基的启动子克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘蒙蒙 张全启 王晶 马丽曼 高金宁
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 牙鲆 激活素 启动子 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 页码范围: 41-47
• 页数: 7页
• 分类号: S96
• 字数: 4427字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11758/yykxjz.20150106

摘要

以牙鲆为研究对象，利用染色体步移(Genome walking)获得了 Activin 两个β亚基基因的上游部分启动子序列，并对其进行了转录调控元件的生物信息学预测分析。获得了 Activin βA 和βB两个亚基的启动子部分序列，长度分别约为2.7 kb 和2.4 kb；在预测的 Activin βB 转录起始位点(+1位)的上游31 bp 处有1个典型的 TATA box，而在 Activin βA 中未发现 TATA box 的存在。两个基因的启动子上发现了多个转录因子 Sp1、Oct-1、C/EBP、CREB、GATA-1、HNF-3、HNF-1、USF 等结合位点，还发现了与内分泌相关的 Pit-1、ER、PR、GR、RAR、RXR 等结合位点，但肌性转录因子 MyoD、myogenin 和雄性的性别决定基因 SRY 结合位点仅在 Activin βA 启动子中发现。生物信息学分析显示，牙鲆 Activin βA 和βB 表达受到多种潜在因子的调控，二者在调控上有所差异。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王晶	中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	97	473	12.0	18.0
2	张全启	中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	35	632	12.0	24.0
3	高金宁	中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	3	5	2.0	2.0
4	马丽曼	中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	2	2	1.0	1.0
5	刘蒙蒙	中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0