红花(Carthamus tinctorius L.)不同开花时期的转录组测序及黄酮合成相关基因的验证

• 作者: 刘秀明 姚娜 崔喜燕 张宇 李晓薇 李海燕 王南 王立勇 董园园
• 来源期刊: 中国细胞生物学学报
• 关键词: 红花 转录组测序 黄酮合成
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1207-1215
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11844/cjcb.2015.09.0219

摘要

应用454测序技术对红花(Carthamus tinctorius L.)初花期和盛花期两个样本进行转录组测序,分别获得了577 664和562 930条Clean reads片段,其平均长度分别为427 bp和436 bp.差异表达分析结果发现,在初花期获得40 139个基因,盛花期获得39 768个基因,在两个时期同时表达的基因有28 316个.COG/KOG分析中,获得了大量与代谢相关的功能注释信息,注释到比例最高的为功能预测,占24.681％. KEGG Pathway富集分析中,找到红花黄酮化合物合成途径中的关键酶基因,利用Real-time PCR方法验证了三个基因的正确性.表达量分析表明,查尔酮合酶在两个红花品种中各个开花时期的相对表达量最高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚娜		19	47	4.0	5.0
2	张宇		25	134	8.0	10.0
3	刘秀明		21	68	5.0	7.0
4	李海燕		68	318	10.0	16.0
5	王南		16	75	5.0	8.0
6	董园园		19	53	4.0	6.0
7	李晓薇		13	62	5.0	7.0
8	崔喜燕		1	0	0.0	0.0
9	王立勇		1	0	0.0	0.0