大肠杆菌的同义密码子使用偏性对蛋白质折叠速率的影响

• 作者: 于志芬 李瑞芳 黄俏
• 来源期刊: 内蒙古师范大学学报（自然科学汉文版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 大肠杆菌 核蛋白 同义密码子 使用偏性 蛋白质折叠速率
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 物理与工程技术
• 页码范围: 467-473
• 页数: 7页
• 分类号: Q61
• 字数: 3586字
• 语种: 中文

摘要

考虑到同义密码子使用偏性的物种差异性，选取大肠杆菌的54条核蛋白为研究对象，将每条核蛋白按二级结构截取出α螺旋片段、β折叠片段和无规卷曲(α-β混合)片段，然后找到每个片段相关的核酸序列信息，计算其同义密码子使用度和相应肽链的折叠速率。在此基础上，分析了同义密码子使用偏性和相应肽链折叠速率之间的相关性，发现对于不同二级结构类的肽链片段，都有部分密码子的使用偏性与其对应的肽链折叠速率显著相关。因此，在蛋白质折叠中，同义密码子的使用偏性起着重要作用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	于志芬	内蒙古师范大学物理与电子信息学院	6	3	1.0	1.0
2	李瑞芳	内蒙古师范大学物理与电子信息学院	19	26	3.0	4.0
3	黄俏	内蒙古师范大学物理与电子信息学院	6	3	1.0	1.0